Un equipo de investigadores rusos reveló los mecanismos detrás de la aparición de variantes nuevas y peligrosas del virus Corona, como Alpha, Delta, Omicron y otras.
El equipo, dirigido por miembros de la Escuela Superior de Economía (HSE) de la Universidad Nacional de Investigación, descubrió que la probabilidad de que ocurra una sustitución en un sitio particular del genoma del SARS-CoV-2 depende de las sustituciones compatibles que ocurran en otros sitios.
Esto explica por qué nuevas y más infecciosas variantes del virus han surgido inesperadamente y difieren significativamente de las que circularon anteriormente, escriben en el artículo publicado en la revista eLife.
Todos los virus cambian con el tiempo, incluido el virus SARS-CoV-2 responsable de la pandemia de coronavirus. Cuanto más tiempo circula el virus en una población y más individuos infectados con él, más cambios (mutaciones) acumula. Las nuevas cepas del virus suelen ser similares a sus cepas parentales.
Sin embargo, en algunos casos, las mutaciones pueden dar lugar a variantes que se adapten mejor al medio ambiente y supongan un mayor riesgo para la salud humana. Estas variantes tienden a propagarse más rápidamente, pueden no responder a las vacunas o tratamientos actuales y pueden ser más difíciles de diagnosticar.
“La evolución de un virus dentro de una comunidad se puede comparar con un viaje a través de un vasto terreno con valles, gargantas y colinas. El virus deambula aleatoriamente por ese paisaje, muere rápidamente si queda atrapado en una cavidad y vive más tiempo en los valles. “, dijo Alexei Neverov, del HSE International Laboratory of Statistical Genomics. Y el contador:
Para el estudio, el equipo analizó más de tres millones de secuencias genómicas de diferentes cepas del SARS-CoV-2. Identificaron ubicaciones específicas en la superficie de la proteína del coronavirus donde ocurrieron sustituciones de aminoácidos, distinguiendo las variantes tanto de la cepa original de Wuhan como entre sí.
Muchos de estos sitios parecen evolucionar de manera concordante, de modo que los cambios en los aminoácidos en un sitio son seguidos rápidamente por cambios en otro. Todas las variantes activas y virulentas del virus se distinguieron de las variantes previamente dominantes por patrones de sustituciones múltiples.
“Las personas con COVID-19 a largo plazo pueden tener una acumulación de variantes que no están bien adaptadas para sobrevivir en la población general. Sin embargo, con el tiempo, estas variantes pueden evolucionar hacia formas más fuertes que tienen el potencial de propagarse ampliamente e invadir”. Mundo Neverov explicó.
El equipo propone una explicación de por qué no surgen variantes intermedias que se diferencian del virus original por solo una o dos sustituciones. Es posible que estas variantes “débiles” se vuelvan “fuertes” solo cuando combina el patrón completo de sustituciones individualmente dañinas. Como resultado, dijeron los investigadores, es difícil predecir la aparición de una nueva cepa altamente adaptable.
El método estadístico utilizado por los autores del estudio es versátil y se puede utilizar para investigar la evolución de muchos otros patógenos. En particular, este enfoque se ha aplicado con éxito para estudiar el desarrollo de la gripe y la tuberculosis.
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